Объединённый учёный совет является совещательным органом Центра, деятельность которого основывается на демократических принципах свободного обсуждения и коллективного решения стратегических вопросов развития научных исследований, научно-организационной и научно-технической деятельности.
Состав Объединённого учёного совета формируется из числа ведущих учёных, руководителей структурных подразделений сроком на один год и утверждается приказом директора Центра.
Решения Объединённого учёного совета по вопросам, относящимся к его компетенции, являются обязательными для выполнения всеми сотрудниками Центра.